肿瘤遗传易感基因检测

肿瘤遗传易感基因检测

筛查家族遗传性肿瘤相关基因,评估发病风险。

背景介绍

约5%–10%的肿瘤具有家族遗传倾向,主要由胚系致病基因变异引起。这些变异可通过常染色体显性方式遗传。胚系DNA筛查采用下一代测序(NGS)技术,对血液或唾液样本中的肿瘤易感基因进行分析,检测SNV、Indel及CNV,从而识别携带者。

单病种/核心基因针对性检测

  • 遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征(HBOC):BRCA1、BRCA2(最核心)
  • 扩展乳腺-卵巢相关:常加ATM、CHEK2、PALB2、BRIP1、RAD51C、RAD51D、BARD1、NBN、PTEN、TP53、CDH1等
  • 林奇综合征(Lynch综合征,遗传性非息肉性结直肠癌):MLH1、MSH2、MSH6、PMS2、EPCAM
  • 家族性腺瘤性息肉病(FAP):APC
  • 其他单病种:CDH1(遗传性弥漫性胃癌)、STK11(Peutz-Jeghers综合征)、TP53(Li-Fraumeni综合征)、PTEN(Cowden综合征)等

多癌种/综合panel项目

项目1: 标准多癌种遗传风险评估Panel

  • 基因数量:约40–60个基因。
  • 覆盖基因:高穿透率基因(BRCA1、BRCA2、TP53、PTEN、APC、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2、EPCAM、CDH1、STK11);中度风险基因(ATM、CHEK2、PALB2、BRIP1、RAD51C、RAD51D、BARD1、NBN、NF1、HOXB13等)。
  • 覆盖癌种:乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、胃癌、前列腺癌、胰腺癌、子宫内膜癌(聚焦高发和高证据癌种)。
  • 适用人群:家族史明确、早发癌或符合NCCN基本高危标准的人员;适合大多数临床筛查场景。

项目2: 扩展多癌种综合易感Panel

  • 基因数量:约150–200个基因。
  • 覆盖基因示例:标准基因外大幅扩展,包括罕见综合征基因(BAP1、CDK4、CDKN2A、POT1、SMAD4、BMPR1A、MUTYH、AXIN2、POLD1、POLE、FH、FLCN、SDHx系列、VHL、RET、MEN1、MAX、TMEM127等);新兴/中低风险基因(RECQL、FANCM、XRCC2等)。
  • 覆盖癌种:乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌、胃癌、前列腺癌、胰腺癌、子宫内膜癌、黑色素瘤、肾癌、甲状腺癌、神经内分泌肿瘤、肉瘤、内分泌肿瘤等。
  • 适用人群:家族史复杂、多原发癌、涉及罕见癌种或多综合征重叠的人员;适用于需全面排除遗传因素的复杂病例。

项目3: 全外显子组癌症易感优化分析

  • 基因数量:全外显子组(WES,约20,000个蛋白编码基因),重点解读与癌症易感相关的数百至数千个基因(包括已知癌症基因+新兴候选基因+全外显子数据挖掘)。
  • 覆盖基因示例:覆盖所有已知高/中/低风险癌症基因(如上述项目1+2全部基因),并扩展至潜在新型风险基因、修饰基因或多基因风险位点;可结合polygenic risk score(PRS)分析。
  • 覆盖癌种:全面泛癌种,包括常见癌(乳腺、卵巢、结直肠等)和罕见/新兴癌(肝癌、肺癌、脑瘤、肉瘤、血液肿瘤等),适用于异质性强或表型不典型的家族。
  • 适用人群:高度复杂家族史(多人多癌种、多代早发)、标准panel阴性但高度怀疑遗传因素、或需同时评估其他遗传病的人员。

临床意义与参考文献

临床意义

通过系统分析个人及家族肿瘤史并结合基因检测,精准识别携带胚系致病变异的高风险个体,从而指导强化筛查、预防性干预、靶向治疗选择以及家族级联管理,实现癌症的早期发现、发病率降低和整体预后改善。

支持文献

  • Garber JE, Offit K. J Clin Oncol. 2005.
  • LaDuca H, Stuenkel AJ, Dolinsky JS, et al. Genet Med. 2014.
  • Desmond A, Kurian AW, Gabree M, et al. JAMA Oncol. 2015.
  • LaDuca H, Polley EC, Yussuf A, et al. Genet Med. 2020.
  • Neben CL, Zimmer AD, Stedman J, et al. J Mol Diagn. 2019.

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